磁粉制动器长时间发烫严重，是因为超负荷负载了，或者是磁粉的质量太差、磁粉不足使扭矩不足等，如果长时间持续发烫，很容易影响制动器的性能和使用寿命。磁粉制动器内部构造比较精密，如果仅仅靠自热冷却是很难达到高效散热的，我们只能再加上外部散热。
磁粉制动器可以使用热块冷却方式，虽然设置有轴流式风扇（鼓风机），但如果该轴流式风扇能力降低，散热效果恶化，会导致允许连续滑差功率降低，因此在安装时请务必在周围预留一定的空间。特别是周围环境恶劣时，轴流风扇防护栅可能会附着异物，请定期予以清扫。
磁粉制动器有水冷和自冷两种，自冷的由本身装置的铝壳盖进行散热，水冷的则依靠水散热，这两种散热方式就是降低磁粉制动器内部与表面温度。两种散热方式没有的好坏，因为用途不同，选择也不同，但是用户一般都会优先选择自冷的磁粉制动器。